Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA4CQ9C0C4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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SEMA4CQ9C0C4 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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SEMA4CQ9C0C4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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