Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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