Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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CHD4Q14839 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CHD4Q14839 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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