Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC100860.1-201ENST00000517606 1064 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ULK4P3-201ENST00000563895 440 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC020907.2-202ENST00000592174 728 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MUC20-204ENST00000445522 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 NOS2-201ENST00000313735 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HCRTR2-202ENST00000615358 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PTPN20-201ENST00000374218 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TSPAN31-206ENST00000547992 3434 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ABCC11-203ENST00000394747 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 KCNMA1-AS1-206ENST00000600782 1755 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 NVL-202ENST00000340871 2431 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CYB561A3-221ENST00000546151 3986 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL139220.2-213ENST00000431800 674 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RN7SL35P-201ENST00000466169 292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RPL12P37-201ENST00000486874 495 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HOXB-AS1-203ENST00000504972 680 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 WBP1LP2-201ENST00000515260 998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ACTBP6-201ENST00000520036 1090 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC091144.2-201ENST00000521717 433 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 LINC01579-201ENST00000553818 561 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HLA-P-207ENST00000568192 747 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC005180.1-201ENST00000591137 587 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZNF528-210ENST00000594530 544 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZNF677-208ENST00000599012 796 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL590491.1-202ENST00000618038 394 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AC025822.2-201ENST00000455199 2287 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PRMT3-203ENST00000437750 1736 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SLFN12-202ENST00000394562 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 SYT14-202ENST00000367019 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZSCAN31-202ENST00000396838 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PPARGC1A-206ENST00000507380 2385 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 ENPP6-201ENST00000296741 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PPP1R14D-201ENST00000299174 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
MKRN4PQ13434 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms