Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SP140Q13342 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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SP140Q13342 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SP140Q13342 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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