Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CENPFP49454 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CENPFP49454 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CENPFP49454 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CENPFP49454 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms