Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms