Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
COL4A6Q14031 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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COL4A6Q14031 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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