Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms