Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
EPHB4P54760 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms