Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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