Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 DEPDC5-206ENST00000400249 5458 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CREM-207ENST00000356917 1895 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SERPINA9-202ENST00000337425 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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