Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms