Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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LAMA3Q16787 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 COL4A6-203ENST00000394872 6750 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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LAMA3Q16787 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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LAMA3Q16787 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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LAMA3Q16787 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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