Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
R3HDM1Q15032 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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