Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF1Q13077 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms