Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
EPHB4P54760 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms