Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRIM23P36406 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRIM23P36406 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms