Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRZ1P23471 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC115837.1-201ENST00000517662 1001 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRZ1P23471 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms