Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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