Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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