Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CENPFP49454 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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