Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TCF4-254ENST00000626584 1701 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01140-210ENST00000590653 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TRHP20396 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 PPP3CB-AS1-203ENST00000442133 2888 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 FSHR-201ENST00000304421 2176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 GPR156-203ENST00000464295 4442 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 GPR155-203ENST00000392552 6730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL117190.2-201ENST00000554041 289 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AC009948.1-205ENST00000453026 2007 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 LOXHD1-212ENST00000582408 3755 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TRHP20396 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TRHP20396 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TRHP20396 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TRHP20396 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TRHP20396 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 XKRX-201ENST00000372956 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 LINCMD1-201ENST00000418518 462 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TRHP20396 CACNB2-204ENST00000377315 3461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms