Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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HOXD8P13378 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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HOXD8P13378 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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