Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms