Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.2 ms