Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CEP44Q9C0F1 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CEP44Q9C0F1 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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