Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL358452.1-201ENST00000414995 800 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PHACTR1Q9C0D0 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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