Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC96Q2M329 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC96Q2M329 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC96Q2M329 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC96Q2M329 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC96Q2M329 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC96Q2M329 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC96Q2M329 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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