Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms