Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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