Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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