Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PFDN4Q9NQP4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms