Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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COL24A1Q17RW2 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
COL24A1Q17RW2 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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