Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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