Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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