Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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