Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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