Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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