Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CHRNA6-205ENST00000534622 1872 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TYRP1-203ENST00000388918 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AL121936.1-201ENST00000641660 2884 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MKL2-207ENST00000573051 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ZNF594-202ENST00000575779 4335 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CORO2B-203ENST00000543950 3611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 HNRNPCP7-201ENST00000456056 905 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TARID-209ENST00000630119 4294 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 DAB2-201ENST00000320816 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 TCTN3-203ENST00000371217 2514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CYP4A22-203ENST00000371891 2535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ZNF596-202ENST00000320552 2696 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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