Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SNHG14-208ENST00000453082 6087 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LAMA3Q16787 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms