Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SRSF5Q13243 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms