Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 PTK2-241ENST00000522950 548 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RFX4-202ENST00000357881 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 2102 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SH3BP2P78314 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms