Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CASQ1P31415 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CASQ1P31415 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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