Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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