Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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COL24A1Q17RW2 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL24A1Q17RW2 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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