Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NTRK2Q16620 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms