Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRIM6-212ENST00000621176 3005 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SOCS6-203ENST00000582322 2625 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LGALS8-202ENST00000323938 1855 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC02150-201ENST00000513157 2120 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SPX-201ENST00000256969 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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