Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ANK3Q12955 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms