Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD8P13378 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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